现代社会的综合治理管理系统是为了提高城市社会管理效率，有效防范和解决各类社会问题而建立的。然而，在实际运行中，人们渐渐发现综治管理系统存在着一系列问题和困局，迫切需要进行改进和完善。

首先，综治管理系统存在的一个问题是信息共享不畅。在跨部门合作的过程中，各个部门之间的信息共享不足，导致信息孤岛现象严重。这就给问题的解决增加了困难，也使得城市管理效率降低。如果信息无法及时传达和共享，各部门之间也难以形成合力，对城市问题的解决一定会产生阻碍。
     其次，综治管理系统在责任界定上存在一定的模糊性。由于各部门之间的权责划分不清晰，很多问题的处理上存在推诿责任和各扫门前雪的现象。这种情况导致了对于责任人的追责难度增加，也会让问题得不到有效解决，影响了综治管理系统的进程。
     此外，综治管理系统在应对新兴社会问题方面存在着滞后性。面对着新的社会问题的出现，综治管理系统却往往束手无策，缺乏应对之策，导致这些问题在社会中蔓延。综治管理系统应该具备更强的应变能力和更新升级的机制，以便更好地适应社会的发展和变化。

    另外，综治管理系统中数据的安全性也是一个亟待解决的问题。由于信息技术的发展，数据在系统中的重要性越来越凸显，数据泄露和数据篡改等问题也日益增多。如果综治管理系统无法保障数据的安全性，就会给城市带来更大的风险和隐患，甚至威胁到社会的安定。

综治管理系统在城市社会管理中扮演着重要的角色，但是在实际运行中也暴露出一些问题和困难。只有通过改进和完善，才能更好地发挥其作用，为城市社会管理带来更大的效益和便利。希望相关部门能够积极应对，解决这些问题，推动综治管理系统向着更加完善的方向发展。